在充分考虑国泰君安与海通证券原有组织架构，吸收借鉴双方特色优势的基础上，国泰海通进一步调整了公司组织架构。

具体来看，公司设立财富管理委员会、研究与机构业务委员会、投资银行业务委员会、固定收益业务委员会、权益业务委员会、信用业务委员会、金融科技委员会共七个实体化运作的委员会。

公司设置41个总部部门，其中财富管理委员会下设客群发展部、私人客户部、资产配置部、财富平台部、交易服务部五个一级部门；研究与机构业务委员会下设研究所、政策和产业研究院、机构销售部、海外机构销售部、资产托管部五个一级部门；投资银行业务委员会下设投资银行部、债务融资部、资本市场部、质量控制部、投行大客户部五个一级部门；固定收益业务委员会下设固定收益投资部、固定收益客需部、固定收益销售部三个一级部门；权益业务委员会下设证券衍生品投资部、权益投资部、权益客需部三个一级部门；信用业务委员会下设融资融券部、质押融资部两个一级部门；金融科技委员会下设金融科技部、技术研发部、系统运行部、数据管理应用部四个一级部门。

此外，公司另设战略客户部、营运管理部、法律合规部、风险管理部、内核风控部、审计部、计划财务部、资产负债部、战略发展部（数字化转型办公室）、整合工作办公室、人力资源部、办公室、行政事务部、董事会办公室等一级部门。

另外，整合后有上海、浙江、北京、深圳、广东、江苏等44家分公司。各类子公司将在过渡期内并行运作。